Decolando na velocidade da luz, a infame Equipe Rocket invadiu as Poképaradas de Pokémon Go e está mantendo um Pokémon das Sombras como refém. Para triunfar nesse evento, os jogadores precisam decifrar o mistério dessa criatura.
O Professor Willow e os líderes de equipe estão trabalhando em conjunto para impedir o que quer que a Equipe Rocket esteja aprontando. Para participar dessa brincadeira, é necessário ficar de olho nas Poképaradas descoloridas com o símbolo dos adversários, onde os vilões estarão se reunindo. O jogador deverá então aceitar os duelos dos recrutas da Equipe Rocket e fazer de tudo para vencê-los em batalha.
Entretanto, o evento não para por aí: após vencer a Equipe Rocket, o jogador terá que capturar o Pokémon das Sombras que os vilões abandonaram para trás. Sentindo muita dor, a criaturinha foi corrompida por um plano maligno que pretendia aumentar seu poder de forma artificial. O jogador precisará purificar o Pokémon das Sombras, com Poeira Estelar e Doces. O processo irá tornar o Pokémon mais forte que o normal, sem sofrer consequências, graças à gratidão que ele sentirá pelo Treinador que o ajudar.